MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 5911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007146	T	6	6	1059	1064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007146	AAT	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007146	CAAT	2	8	1127	1134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007146	TTC	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007146	CTTT	2	8	3038	3045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007146	TGTA	2	8	4408	4415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007146	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007146	CCA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007146	TC	3	6	4561	4566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007146	TTA	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007146	ATT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007146	TTG	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007146	A	6	6	5507	5512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007146	GAT	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007146	TA	3	6	5557	5562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007146	AG	3	6	5565	5570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007146	CTA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007146	CTAT	2	8	5621	5628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007146	CAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007146	TTG	3	9	5643	5651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007146	GAAAAA	2	12	10411	10422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007146	TAT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007146	GA	3	6	10461	10466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007146	TTA	2	6	12315	12320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007146	A	7	7	13371	13377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007146	AAT	2	6	13388	13393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007146	TATT	2	8	13405	13412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007146	GAAAAG	2	12	17955	17966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007146	AAAAC	2	10	17994	18003	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007146	T	8	8	18025	18032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007146	CCT	2	6	18436	18441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007146	ATA	3	9	18455	18463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007146	ATT	2	6	18503	18508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007146	ATTT	2	8	18513	18520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007146	T	7	7	18537	18543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007146	AATT	2	8	18544	18551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007146	TTA	2	6	18578	18583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007146	TAAA	2	8	18589	18596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007146	AAT	2	6	18606	18611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007146	TTA	2	6	18669	18674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007146	AT	3	6	19351	19356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007146	A	6	6	19361	19366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007146	TC	3	6	19381	19386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007146	AAT	2	6	20868	20873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007146	A	6	6	20990	20995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007146	AT	3	6	21155	21160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007146	ACT	2	6	21170	21175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007146	CTA	2	6	21180	21185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007146	TTAAA	2	10	21203	21212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007146	A	7	7	21210	21216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007146	AAAT	2	8	24086	24093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007146	TTTC	2	8	24169	24176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007146	TTCC	2	8	26925	26932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007146	TGA	2	6	26939	26944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007146	A	6	6	27974	27979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007146	GAA	2	6	27980	27985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007146	AACAT	2	10	27986	27995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007146	TAG	2	6	28007	28012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007146	TAT	2	6	28021	28026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007146	AAT	2	6	28115	28120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007146	GCAA	2	8	28176	28183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007146	TAAA	2	8	29188	29195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007146	TTTC	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007146	ATAAA	2	10	30164	30173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007146	GT	3	6	31388	31393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007146	TTCT	2	8	32289	32296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007146	AAGA	2	8	32299	32306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007146	A	7	7	32306	32312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007146	A	6	6	36298	36303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007146	ATT	2	6	36344	36349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007146	A	6	6	38085	38090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007146	T	6	6	38107	38112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007146	A	6	6	40002	40007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007146	T	7	7	40025	40031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007146	T	6	6	40048	40053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007146	T	6	6	40079	40084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007146	CAAA	2	8	40087	40094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007146	T	7	7	41230	41236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007146	CAA	2	6	41241	41246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007146	GA	3	6	42806	42811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007146	CT	4	8	42815	42822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007146	T	6	6	42822	42827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007146	TAT	2	6	44473	44478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007146	A	6	6	46238	46243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007146	ATAA	2	8	46966	46973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007146	TCT	2	6	46978	46983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007146	A	6	6	47004	47009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007146	AATT	2	8	47027	47034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007146	TCA	2	6	47035	47040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007146	ATC	3	9	47054	47062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007146	ATC	2	6	47072	47077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007146	TAC	2	6	47111	47116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007146	ATCA	2	8	47121	47128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007146	GGA	2	6	47130	47135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007146	CCT	2	6	47187	47192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007146	TCC	2	6	47210	47215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007146	A	6	6	48263	48268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007146	AAAT	2	8	48304	48311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007146	ATG	3	9	51293	51301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007146	ACA	2	6	51325	51330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007146	CAG	2	6	51390	51395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007146	TCA	2	6	51429	51434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007146	A	6	6	51465	51470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007146	TCA	3	9	51572	51580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007146	CTT	2	6	51635	51640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007146	T	6	6	51696	51701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007146	AGA	2	6	51708	51713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007146	A	6	6	51727	51732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007146	TAAA	2	8	51774	51781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007146	TGC	2	6	51846	51851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007146	GATT	2	8	51853	51860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007146	TTTG	2	8	51949	51956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007146	TGA	2	6	52044	52049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007146	CAC	2	6	52088	52093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007146	T	7	7	52163	52169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007146	ATG	2	6	52171	52176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007146	TAA	2	6	52185	52190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007146	TTA	2	6	54002	54007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007146	TATGA	2	10	56104	56113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007146	TAA	2	6	56968	56973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007146	A	6	6	58191	58196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007146	ATT	2	6	58198	58203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007146	ATG	2	6	58994	58999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007146	AAC	2	6	61681	61686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007146	TAA	2	6	62714	62719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007146	AAT	2	6	62760	62765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007146	TAA	2	6	62766	62771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007146	A	6	6	66950	66955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007146	TC	3	6	66966	66971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007146	TTTA	2	8	66987	66994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007146	AAAT	2	8	67038	67045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007146	ACAA	2	8	67071	67078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007146	CCGC	2	8	67094	67101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_007146	TGTA	2	8	67181	67188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007146	T	6	6	67686	67691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007146	ATTT	2	8	67751	67758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007146	CAA	3	9	67760	67768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007146	ATT	2	6	67779	67784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007146	CTTA	2	8	67785	67792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007146	TTTG	2	8	67802	67809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007146	AAG	2	6	67812	67817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007146	A	7	7	67820	67826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007146	TTCA	2	8	69795	69802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007146	TTC	2	6	73486	73491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007146	TCA	2	6	77411	77416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007146	TCT	2	6	77421	77426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007146	ATTTA	2	10	79180	79189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007146	T	6	6	79200	79205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007146	T	6	6	81669	81674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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